транспондер - по простому - нужен для идентификации ключа. Опрашивается при включении зажигания, передаёт данные, хранящиеся в его памяти.
плата радиомодуля передаёт другой код и служит для управления центральным замком. К иммобилайзеру отношения не имеет.
Для пежо 307:
общее между этими устройствами - пин-код, на основании которого генерируется содержимое памяти каждого из устройств.
При процедуре прописки ключа это содержимое (постоянная часть) записывается в чип и память чипа радиомодуля, а также в дамп бси. Есть ещё переменная часть кода, которая синхронизируется кнопками платы.